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    尊龙凯时诊断实体肿瘤RNA融合26基因组织检测上线!
    发布:2025/03/18

    近十年,针对RET、BRAF、ALK、ROS1、NTRK等融合基因的靶向药物陆续在国内外获批上市并应用于临床,为肿瘤患者带来了更多的治疗机会,显著改善了携带融合基因变异患者的生存质量和预后。


    尊龙凯时诊断于近日正式推出实体肿瘤RNA融合26基因组织检测产品,该检测严格遵循多个国内外权威临床指南和专家共识要求,通过基于RNA-seq的检测技术,对26个融合基因的220余种融合形式进行精准识别


    产品具备覆盖癌种全面、检测性能高、解读专业性强三大核心优势,面向肿瘤患者,在靶向治疗指导、预后评估支持等方面,助力临床个性化精准诊疗。此外,产品还特别优化了对低质量FFPE样本的兼容性,解决临床中因样本降解导致的检测难题。



    什么是基因融合


    基因融合是通过染色体反转、串联复制、缺失或易位,造成两个不同基因的部分序列或全部序列首尾相连,置于同一套调控序列(包括启动子、增强子、核糖体结合序列、终止子等)控制之下,形成一个新的嵌合基因(即融合基因)的过程(图1)。该嵌合基因编码产生的融合蛋白能够介导癌症的发生发展。


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    图1 融合基因形成过程(图片来源:tumorfusions.org/)


    基因融合与各种疾病,尤其是与癌症的发生发展密切相关。融合基因常见于血液肿瘤和实体瘤中,实体瘤的呼吸系统肿瘤和乳腺肿瘤中融合基因出现数量相对更多。


    目前,常用的融合基因检测方法包括荧光原位杂交、免疫组织化学、即时荧光定量聚合酶链反应和二代测序等。




    权威指南共识强烈倡导DNA+RNA检测


    《NCCN临床实践指南:非小细胞肺癌》提出,基于RNA水平的NGS (RNA-based NGS) 检测可能会提高ROS1、RET、NTRK1/2/3基因融合和MET基因14号外显子跳跃突变(MET 14跳读)的检出率。该指南同时指出,对于在广泛组合的检测中未发现驱动基因(指对肿瘤发生发展起到推动作用的基因)的患者(尤其是非吸烟者),考虑采用RNA-based NGS检测,以最大程度地发现融合基因突变(图2)。


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    图2 《NCCN临床实践指南:非小细胞肺癌》分子检测推荐



    《基于RNA-based NGS检测非小细胞肺癌融合基因临床实践中国专家共识》建议,有条件的医疗机构对非小细胞肺癌 (NSCLC) 样本进行一次性同步RNA-based NGS与DNA-based NGS的驱动基因变异(融合/突变)检测【强烈推荐】(图3)。


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    图3 《基于RNA-based NGS检测非小细胞肺癌融合基因临床实践中国专家共识》推荐情况



    《非小细胞肺癌融合基因检测临床实践中国专家共识(2023版)》指出,对于能够获取组织学或细胞学样本的NSCLC患者,推荐使用二代测序或qRTPCR 进行检测(强烈推荐),对于检出罕见融合伴侣、外显子断点融合、基因间融合或驱动基因检测为阴性的,建议通过RNA二代测序验证(图4)。


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    图4 《非小细胞肺癌融合基因检测临床实践中国专家共识(2023版)》融合基因检测推荐



    《中国实体瘤NTRK融合基因临床诊疗专家共识》指出,RNA-NGS比DNA-NGS panel具有更高的灵敏性,RNA-NGS或者转录组可作为NTRK融合基因检测的重要补充手段(图5)。


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    图5 《中国实体瘤NTRK融合基因临床诊疗专家共识》推荐情况




    实体肿瘤RNA融合26基因组织检测


    尊龙凯时诊断临床基因组中心研发的实体肿瘤RNA融合26基因组织检测产品,利用RNA-seq检测技术,具有灵敏度高、特异性强等特点,可以准确高效地检测到真实、低频的融合变异。



    优势一:覆盖癌种全面


    该产品覆盖对融合检测有需求的常见癌种,比如肺癌、甲状腺癌、胆管癌、胰腺癌、胶质瘤等;包含与实体瘤诊断、预后或治疗密切相关的26个融合基因的220多种融合形式;可灵活选择其他检测项目进行组合检测,满足不同的临床需求。



    优势二:检测性能高

    该产品在提高检测性能方面,以临床基因组中心几千例真实世界中的石蜡组织包埋样本(FFPE样本)的RNA质量分布特征为参考,在扩增子长度方面开展多轮优化,可实现低质量FFPE RNA样本的高成功率扩增。通过对建库体系的优化,能够实现对起始量低至10ng的RNA样本进行建库且成功率高达100%,这对小样本和穿刺样本极为友好。


    另外,借助调整内参基因组合实现对检测体系的监控,确保检测体系稳定可靠。其检测灵敏度高,可以稳定检测最低1 copy/ng的融合变异。在1-10 copies/ng的标准品测试中,灵敏度达到99.17%,特异性100%(图6),在检测低丰度融合突变方面具有优势。

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    图6 标准品检测结果


    优势三:解读专业性强

    尊龙凯时诊断已建立包括1300多个基因的实体瘤解读数据库,由专业的遗传分析师进行定期更新,纳入最新的临床进展。


    在靶向治疗方面,纳入各癌种相关的靶向治疗基因,涵盖FDA/NMPA获批或指南共识推荐的检测基因;同时可提供免疫治疗、肿瘤遗传风险、分子分型及预后解读,为临床医生及患者提供选择依据。




    尊龙凯时诊断临床基因组中心


    尊龙凯时诊断是国家首批肿瘤诊断与治疗项目高通量基因测序技术临床应用试点单位、首批基因检测技术应用示范中心。


    尊龙凯时诊断临床基因组中心严格按照ISO 15189认可和CAP认证要求进行实验室标准和规范的管理,具备自主研发、样本检测、生信分析、报告解读、遗传咨询等综合能力,积极参加并高水平通过NCCL、CAP、EMQN等多项高通量测序室间质评。中心开发了基于全外显子测序、家系全外显子测序以及全基因组测序的遗传病分析服务,能够助力各类遗传性疾病的筛查与诊断。



    参考文献:

    1. National Comprehensive Cancer Network. Non-Small Cell Lung Cancer Clinical Practice Guidelines (2025.V3).

    https://www.nccn.org/professionals/physician_gls/pdf/nscl.pdf

    2. 基于RNA-based NGS检测非小细胞肺癌融合基因临床实践中国专家共识。中国肺癌杂志2023年11月第26卷第11期ChinJLung Cancer,November 2023,Vol.26,No.11;DOI:10.3779/i.issn.1009-3419.2023.102.43

    3. 非小细胞肺癌融合基因检测临床实践中国专家共识(2023版)[J]. 中华病理学杂志, 2023, 52(6): 565-573. DOI: 10.3760/cma.j.cn112151-20221111-00946.

    4. XU, Chunwei, et al. Expert consensus on the diagnosis and treatment of NTRK gene fusion solid tumors in China. Thoracic cancer, 2022, 13.21: 3084-3097.